A metagenômica é uma técnica independente de cultivo que avalia a diversidade funcional dos microrganismos e sua interação. Segundo o sindicato nacional das indústrias de cimento em 2016, as fábricas produziram juntas 57 milhões de toneladas de cimento. A indústria de cimento possui elevado impacto poluidor em todas as etapas do processo produtivo. Os metais pesados são amplamente estudados devido ao seu alto impacto sobre o ambiente e animais, têm como característica a bioacumulação, o que pode afetar a interação dos microrganismos do solo e consequentemente sua qualidade, o que pode trazer sérios impactos ao meio ambiente. A utilização da metagenômica pode auxiliar na compreensão sobre a microbiota do solo, o que pode ajudar a compreender suas interações e auxiliar assim na tomada de decisão para medidas de sustentabilidade e proteção. Para esse estudo foi adotado a revisão sistemática, integrando as informações acadêmicas de diferentes autores e áreas de conhecimento.