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O trabalho contribui com a questão dos diferentes conflitos e desafios existentes na gestão integrada do território, no qual a gestão é feita a partir de diferentes eixos, sendo eles: administrativo e das águas. Esses eixos se espacializam de diferentes formas sobre o território, no qual a gestão dos recursos naturais se faz distinta do ordenamento territorial, gerando conflitos e desafios na gestão integrada das cidades e dos sistemas ambientais. A partir do referencial bibliográfico e das cartografias produzidas foi possível perceber que a gestão do território é separada do sistema ambiental, o que dificulta uma gestão eficiente dos recursos naturais disponíveis para atender a toda população. Essa situação demanda providências administrativas quanto ao gerenciamento desses eixos para que entrem em concordância e façam uma gestão integrada, priorizando tanto o interesse comum quanto a conservação da natureza.